En su trayectoria artística de cuarenta años Willi Baumeister fue convocado dos veces para ejercer como profesor en una escuela superior de arte. Pero los contenidos y las circunstancias no podían haber sido más disímiles en las dos oportunidades en que ejerció la docencia.
Fráncfort del Meno, de 1928 a 1933
Su primera cátedra, que lo llevó a Fráncfort de 1928 a 1933, fue resultado de su trabajo como tipógrafo a mediados de los años veinte y de su papel como iniciador de nuevas formas de expresión en el grafismo publicitario en Alemania.
Stuttgart, de 1946 a 1955
Su segundo puesto como profesor en su ciudad natal, Stuttgart, entre 1946 y 1955, se debió a su contribución artística al desarrollo de la pintura moderna en Europa, a su conducta irreprochable durante el régimen nazi y al gran prestigio que gozó después de 1945.
El final de la época docente en Fráncfort estuvo marcado por la brusca destitución de su cargo, dado que su forma de pensar y su arte eran incompatibles con el modelo cultural nacionalsocialista. Su actividad docente en Stuttgart culminó con su jubilación como profesor emérito, a la que no obstante siguió poco después su muerte, en agosto de 1955.