No se ha determinado con certeza cuándo comienza el gran interés de Baumeister por el arte no europeo. De todos modos, es probable que descubriera el arte africano alrededor de 1924, cuando conoció en París a sus colegas franceses Le Corbusier, Amedée Ozenfant y Fernand Léger. Las revistas de arte francesas como Cahier d'Art y Documents publicaban regularmente reproducciones de arte africano. Margarete Baumeister, la esposa del artista, descubrió una máscara Senufo procedente de Costa de Marfil en el subsuelo de la Galerie d'Art Contemporain.

Baumeister también tenía gran interés por las esculturas de pequeño formato de la primera Antigüedad procedentes del Mediterráneo y por las ushebtis egipcias. En su colección se encuentran además fósiles, vasijas prehistóricas y hachas de piedra. Durante el tiempo en que fue profesor en la Escuela Municipal de Artes Aplicadas (Städelschule) de Fráncfort aprovechó la oportunidad para asistir a las conferencias del historiador del arte suizo Hans Mühlestein.

Baumeister también era aficionado al arte del antiguo Egipto. Consideraba este arte pintura inmediata, como él mismo expresó, pues estaba creado de formas elementales en tanto que elementos de expresión. En su colección se encuentran algunas ushebtis de madera, así como dos figuras de Osiris hechas en bronce.

Baumeister poseía algunas obras de arte de la América precolombina procedentes de América Central y de las culturas antiguas del Perú. Muchos objetos proceden de una época que precedió al imperio Inca. Incluso en la mímica de algunas figuras hay un simbolismo tan marcado que se comprende el interés de Baumeister por esta cultura. Además, coleccionaba objetos tejidos del Perú antiguo.